20世纪50年代末，在全国“大办农业，大办粮食”热潮中，为适应上海经济发展和文化建设的需要，上海市委作出了建立上海农学院(上海交通大学农业与生物学院前身)的决定。1959年，上海农学院应运而生，校址设在松江县(现松江区)城北。这是上海市历史上的第一所由地方政府主办的高等农业院校，掀开了上海高等农业教育的新篇章。1963年8月，因国家出现经济、财政困难，上海农学院停办。1978年10月，上海农学院在上海县七宝(现属闵行区)恢复重建。1999年9月，上海农学院并入上海交通大学，成立上海交通大学农学院。2002年3月，更名为上海交通大学农业与生物学院。2009年5月，进入教育部、农业部合作共建全国八所涉农高校行列。
并校以来，学院紧密围绕“创建世界一流农科”战略主线，形成并确立了“以农为本、需求牵引、特色发展、争创一流”的办学指导思想，着力加强学科建设、培养与引进***人才，努力提高办学层次、提升人才培养质量，各项事业取得了跨越式发展。学院现有全日制本科专业5个(植物科学与技术、动物科学、园林、资源环境科学、食品科学与工程)，一级学科硕士学位授权点7个(园艺学、畜牧学、生态学、食品科学与工程、风景园林学、植物保护、农业工程)，二级学科硕士学位授权点2个(预防兽医学、作物遗传育种)，一级学科博士学位授权点3个(园艺学、生态学、生物医学工程)，专业硕士学位授权点4个(农业推广、兽医、风景园林、食品工程)。拥有上海市重点学科1个(蔬菜学)，建有蔬菜学、生态学博士后科研流动站。教职工215人(专任教师135人)，其中正高职称教师 50人，副高职称教师56人，具有博士学位的教师124人(海外博士28人)，一年以上海外学习经历的教师94人，中组部“***计划”3人、“青年***计划” 1人，“***”特聘教授1人，讲席教授6人。截至2013年9月，全日制在校生1084人，其中本科生603人、研究生481人(博士生178人)。
学院坚持走“顶天”、“立地”“一体两翼”式发展道路，以农业与生物学院为实体，利用学校多学科优势，注重与工科、理科、医科和管理学科的交叉融合，努力打造***的“顶天”科技创新队伍，致力于农业应用基础研究和开发研究，为农业技术创新提供源头;以挂靠学院的上海交通大学新农村发展研究院为载体，探索农业科技推广专兼职队伍长效机制，加快建设高水平的“立地”农业科技推广队伍，专注于农业科研成果的转化和推广，为国家的农业现代化和社会主义新农村建设服务。学院围绕现代农业与人类健康，着力加强农业科技创新、农业科技推广平台基地建设，不断提升科研水平和质量，在农业优质新品种与资源利用、食品安全与营养、农业环境与生态安全保障、人兽共患疫病的防控、园林生态与景观等多个方向形成特色。现拥有新农村发展研究院(国家级)、农业部都市农业(南方)重点实验室、上海市兽医生物技术重点实验室、上海市食品安全工程技术研究中心等国家级、省部级研究基地。近三年(2011-2013)，科研到位经费总计 2.1亿元，获批千万级国家项目3项，国家自然科学基金立项资助项目56项(重点项目2项);发表SCI/EI论文433篇，专利授权(含软件著作权)194项，新品种审定24项。以学院为第一完成单位获国家科技进步奖二等奖1项，教育部科技进步一等奖2项，上海市科技进步二等奖1项。
